Um arquivo com a extensão de arquivo PDB é provavelmente um arquivo criado no formato de banco de dados de programa que é usado para armazenar informações de depuração sobre um programa ou módulo, como um arquivo DLL ou EXE. Eles às vezes são chamados de arquivos de símbolos.
Arquivos PDB mapeiam vários componentes e instruções em um código-fonte para seu produto final compilado, que o depurador pode usar para localizar o arquivo de origem e o local no executável no qual ele deve parar o processo de depuração.
Alguns arquivos PDB podem estar no formato de arquivo Protein Data Bank. Esses arquivos PDB são arquivos de texto simples que armazenam coordenadas relacionadas às estruturas de proteínas.
Outros arquivos PDB provavelmente são criados no formato de arquivo Palm Database ou PalmDOC e usados com o sistema operacional PalmOS. Alguns arquivos nesse formato usam a extensão de arquivo .PRC.
Como abrir um arquivo PDB
Programas diferentes usam seu próprio arquivo PDB para armazenar dados em algum tipo de formato de banco de dados estruturado, portanto, cada aplicativo é usado para abrir seu próprio tipo de arquivo PDB. Geneious, Intuit Quicken, Microsoft Visual Studio e Pegasus são apenas alguns exemplos de programas que podem usar um arquivo PDB como um arquivo de banco de dados. O Radare e o PDBparse também podem funcionar para abrir arquivos PDB.
Alguns arquivos PDB são armazenados como texto simples, como os arquivos Geneious 'Program Debug Database, e são totalmente legíveis se abertos em um editor de texto. Você pode abrir esse tipo de arquivo PDB com qualquer programa que possa ler documentos de texto, como o programa interno Notepad no Windows. Alguns outros visualizadores e editores de arquivos do PDB incluem o Notepad ++ e os Brackets.
Outros arquivos de banco de dados do PDB não são documentos de texto e são úteis somente quando abertos com o programa para o qual são destinados. Por exemplo, se o seu arquivo PDB estiver relacionado de alguma forma ao Quicken, tente usar esse software para visualizar ou editar o arquivo PDB. O Visual Studio espera ver um arquivo PDB na mesma pasta que o arquivo DLL ou EXE.
Você pode visualizar e editar arquivos PDB que são arquivos do Banco de Dados de Proteína, no Windows, Linux e macOS com o Avogadro. Jmol, RasMol, QuickPDB e USCF Chimera também podem abrir um arquivo PDB. Como esses arquivos são texto simples, você também pode abrir o arquivo PDB em um editor de texto.
O Palm Desktop deve ser capaz de abrir arquivos PDB que estejam no formato de arquivo do Palm Database, mas talvez seja necessário primeiro renomeá-lo para que a extensão de arquivo .PRC desse programa o reconheça. Para abrir um arquivo PalmDOC PDB, tente o STDU Viewer.
Como converter um arquivo PDB
Arquivos de banco de dados do programa provavelmente não podem ser convertidos em um formato de arquivo diferente, pelo menos não com uma ferramenta comum de conversão de arquivos. Em vez disso, se houver qualquer ferramenta que pode converter esse tipo de arquivo PDB, seria o mesmo programa que pode abri-lo.
Por exemplo, se você precisar converter seu arquivo de banco de dados PDB do Quicken, tente usar esse programa para fazê-lo. Esse tipo de conversão, no entanto, provavelmente não é apenas de pouco uso, mas também não é suportado nesses aplicativos de banco de dados (por exemplo, você provavelmente não precisa converter esse tipo de arquivo PDB em nenhum outro formato).
Os arquivos do Banco de Dados de Proteína podem ser convertidos em outros formatos com o MeshLab. Para fazer isso, você pode ter que primeiro converter o arquivo PDB para WRL com PyMOL a partir do Arquivo> Salvar imagem como> VRML menu e, em seguida, importe o arquivo WRL no MeshLab e use o Arquivo> Exportar Malha como menu para finalmente converter o arquivo PDB para STL ou outro formato de arquivo.
Se você não precisa que o modelo seja colorido, pode exportar o arquivo PDB diretamente para o STL com o USCF Chimera (o link de download está acima). Caso contrário, você pode usar o mesmo método acima (com MeshLab) para converter PDB para WRL com USCF Chimera e exportar o arquivo WRL para STL com MeshLab.
Para converter PDB para PDF ou EPUB, se você tiver um arquivo PalmDOC, é possível várias maneiras, mas o mais fácil é provavelmente usar um conversor de PDB on-line como o Zamzar. Você pode carregar seu arquivo PDB para esse site para ter a opção de convertê-lo para esses formatos, bem como para AZW3, FB2, MOBI, PML, PRC, TXT e outros formatos de arquivo eBook.
Para converter o arquivo PDB para o formato FASTA pode ser feito com o conversor PDB on-line do Meiler Lab para o FASTA.
Também é possível converter o PDB em CIF (Formato de Informação Cristalográfica) on-line usando o PDBx / mmCIF.
Leitura avançada em arquivos PDB
Você pode ler muito mais sobre os arquivos do Banco de Dados de Programas da Microsoft, GitHub e Wintellect.
Há mais a aprender sobre os arquivos do Banco de Dados de Proteínas também; veja Worldwide Protein Data Bank e RCSB PDB.
Seu arquivo ainda não está abrindo?
Arquivos PDB que não estão abrindo com nenhuma das ferramentas acima, provavelmente não são arquivos PDB. O que pode estar acontecendo é que você está interpretando mal a extensão do arquivo; alguns formatos de arquivo usam um sufixo que se parece muito com ".PDB" quando eles não são relacionados e não funcionam da mesma maneira.
Por exemplo, um arquivo PDF é um arquivo de documento, mas a maioria dos programas acima não renderiza o texto e / ou imagens corretamente se você tentar abrir um com esses programas de software. O mesmo vale para outros arquivos com extensões de arquivo com a mesma grafia, como arquivos PD, PDE, PDC e PDO.
O PBD é outro que pertence ao programa EaseUS Todo Backup e, portanto, só é útil quando aberto com esse software.
Se você não tiver um arquivo PDB, pesquise a extensão de arquivo que seu arquivo possui para que você possa localizar o programa apropriado que o abra ou converta.
